Deliğin büyüklüğüne ve sayısına göre farklı bulgular görülebilir. Küçük delikler herhangi bir yakınmaya yol açmazlar ve bunların önemli bir kısmı 4-5 yaşlarına kadar kendiliğinden kapanırlar. Nadiren ASD küçük olsa bile toplardamarlardaki bir pıhtı bu delikten sol karıncığa geçerek inme (stroke) gibi şikayetlere yol açabilir

Büyük atrial septal defektlerde ise nefes darlığı, çarpıntı, çabuk yorulma, kilo alamama ve zatürre, bronşit gibi sık tekrarlayan akciğer enfeksiyonları bulunabilir ve kalp yetmezliği gelişebilir.

Eğer zamanında müdahele edilmezse büyük ASD’ler  akciğerlere çok fazla kan gitmesine neden oldukları için 20-30’lu yaşlarda akciğer basıncında artışa (pulmoner hipertansiyon) ve ritm bozukluklarına yol açar.  Bazı hastalarda ASD kapatılsa bile bu sorunlar geri dönmeyebilir. Bu nedenle çok gecikmeden ASD’ler tedavi edilmelidir.